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分子對接的種類主要包括:
(1)剛體對接:指在對接過程中,研究體系(受體和配體)的構象不發生變化。適合考察比較大的體系,如蛋白質和蛋白質間以及蛋白質和核酸之間的對接。
(2)半柔性對接:指在對接過程中,研究體系尤其是配體的構象允許在一定的范圍內變化。適合處理大分子和小分子間的對接,對接過程中,小分子的構象一般是可以變化的,但大分子是剛性的。
(3)柔性對接:指在對接過程中,研究體系的構象基本上可以自由變化的。一般用于精確考慮分子間的識別情況。由于計算過程中體系的構象可以變化,所以計算耗費最大。
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